Фамилия Мульдарова — женская форма, а её мужской вариант — Мульдаров. Написание через «а» на конце указывает на принадлежность к роду (чьи? — Мульдаровы), а сама фамилия, скорее всего, тюркского происхождения. В русском языке фамилии на -ов/-ев, образованные от тюркских основ, не редкость, но в данном случае корень «мульд-» неочевиден и требует разбора.

Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркским словом «мульда» или «мулда». В ряде тюркских языков (казахском, киргизском, башкирском) «мулда» — это вариант произношения слова «мулла»: мусульманский священнослужитель, грамотей, учитель при мечети. Переход «л» в «ль» и последующее «д» — фонетически возможное изменение в диалектах. Таким образом, прозвище Мульда могли дать набожному, грамотному или религиозному человеку, либо тому, кто служил при мечети. Мужская фамилия Мульдаров, соответственно, означала «сын Мульды» или «принадлежащий Мульде».

Менее распространённая, но допустимая гипотеза — связь с арабским именем «Мулла» или «Мулла-Ахмет», которое через тюркское посредство трансформировалось в Мульда. Суффикс -ар- в основе («Мульдар») мог появиться как результат оглушения или диалектного произношения, но в чистом виде «мульдар» в тюркских языках не фиксируется как самостоятельное слово. Поэтому версия с «муллой» выглядит убедительнее.

Географически фамилия Мульдарова встречается преимущественно в регионах с тюркским населением: в Татарстане, Башкортостане, а также среди казахов и киргизов. В русских документах она могла закрепиться в XIX веке при переписях, когда прозвища переводили в официальные фамилии. Сословно носители могли быть как крестьянами, так и представителями духовного сословия, но в основном это сельские жители.

Отдельно стоит отметить, что фамилия Мульдарова не имеет отношения к славянским корням, несмотря на русское окончание. Это типичный пример, когда тюркская основа получила русский суффикс принадлежности, что часто происходило в Поволжье и Приуралье при русификации татарских и башкирских родов.