Фамилия Мурушин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы её разобрать, стоит оттолкнуться от суффикса и географического бытования, а не от корня, который может ввести в заблуждение.

Фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Мурушин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Муруша. Само прозвище Муруша — это краткая, уменьшительно-ласкательная форма от имени или прозвища Мур. А вот что могло значить это «Мур» — здесь начинаются варианты.

Первая и самая вероятная версия — связь с диалектным словом «мурый», которое в северных и сибирских говорах означало «тёмный, серый, бурый». Мурым называли человека с невзрачной внешностью, смуглого, либо того, кто постоянно ходил в тёмной, нечистой одежде. Прозвище Муруша в этом случае — «серенький», «тёмненький». Фамилия органично вписывается в ряд однокоренных: Муров, Муромцев (от «муром» — смуглый, тёмный), Мурашов (от «мураш» — муравей, тоже по цвету или мелкому росту). Эта версия подкрепляется тем, что фамилия Мурушин встречается в основном на Русском Севере и в Поволжье — в Архангельской, Вологодской, Кировской областях, где слово «мурый» было в ходу.

Вторая версия — от тюркского корня «мур» (мурза, мирза), означающего «князь, господин». В этом случае прозвище Муруша могло быть дано человеку с восточными корнями или с властным, гордым нравом. Однако для фамилии с русским суффиксальным оформлением -ин и без явных татарских следов в географии (Мурушины не сконцентрированы в бывших татарских регионах) эта версия менее правдоподобна.

Третья, совсем локальная версия — от глагола «мурыжить» (томить, задерживать, мучить). Прозвище Муруша могли дать медлительному, нудному человеку, который «мурыжит» дело. Но эта связь слабее, так как глагол имеет более позднее происхождение и другую словообразовательную модель.

Таким образом, с большой долей вероятности фамилия Мурушин — это севернорусское или волжское прозвище, данное по цвету волос, кожи или одежды. Предок носителя фамилии был «мурым» — смуглым или темноволосым человеком, либо просто носил тёмную одежду, что и закрепилось в родовом имени.