Фамилия Мурзахожин — характерный пример фамилии, образованной по тюркско-русской модели, где к основе из двух именных компонентов добавили русский патронимический суффикс -ин. В отличие от более массовых -ов и -ев, суффикс -ин в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность к конкретному лицу: «чей?» — Мурзахожин, то есть потомок Мурза-Хожи. Такая модель типична для фамилий, возникших в среде служилых татар и других тюркских народов, вошедших в состав Русского государства, особенно в XV–XVII веках.

Основа фамилии — сложное имя Мурза-Хожа (Мурзаходжа). Первая часть, «мурза» (от персидского «мирза» — «господин», «князь» или «сын эмира»), в тюркской среде означала представителя знатного рода, военного предводителя. Вторая часть, «хожа» (от персидского «хваджа» — «господин», «хозяин»), в исламской традиции закрепилась как титул для купцов, ученых или потомков пророка. Таким образом, имя Мурзаходжа можно перевести как «господин из знатных» или «князь-хозяин» — составное имя, подчеркивавшее высокий статус или социальные амбиции его носителя.

Географически фамилия Мурзахожин тяготеет к регионам с традиционно сильным влиянием тюркских языков: это прежде всего Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также Казахстан. Фамилия встречается и у казахов, где она сохраняет исходную форму без русского суффикса — Мурзахожин или Мурзаходжин. В русском контексте появление суффикса -ин — признак того, что фамилия оформлялась уже в документах на русском языке, где отчество требовало «русификации».

Спорных версий у фамилии немного. Иногда первую часть «мурза» ошибочно связывают с арабским «амир» (эмир), но это разные корни. Вероятнее всего, перед нами не прозвище, а полноценное составное имя, которое давали ребенку с надеждой на его будущее положение. В отличие от многих фамилий, образованных от названий ремесел или внешности, Мурзахожин прямо говорит о социальной среде предков — скорее всего, это были люди из торговой или служилой знати, а не крестьяне.

В русских архивных записях XVIII–XIX веков фамилия могла писаться с колебаниями: Мурзаходжин, Мурзахожин, реже Мурза-Хожин. Вариативность объясняется тем, что писцы передавали тюркское произношение на слух, а единой орфографической нормы для таких фамилий долго не существовало. Современное написание с двумя «ж» закрепилось уже в советских паспортах.