Фамилия Мусабоев — характерный пример фамилий, образованных по тюркской модели с арабским именем в основе. Её ядро — мужское личное имя Мусабай, которое, в свою очередь, составное: «Муса» (арабская форма библейского Моисея, у мусульман один из почитаемых пророков) и «бай» (тюркское «господин», «богатый», «хозяин»). Таким образом, Мусабай дословно означает «господин Муса» или «богатый, как Муса», но в бытовой ономастике имя скорее воспринималось как пожелательное: «пусть ребёнок будет под покровительством пророка Мусы» или «богатый и уважаемый».

Формант -ев указывает на русскую адаптацию фамилии, типичную для многих народов бывшей Российской империи. В тюркских языках (узбекском, таджикском, каракалпакском) притяжательный суффикс, образующий фамилию, чаще выглядит как -ов или -ев, но в русской записи он стандартизирован. Сама фамилия Мусабоев распространена прежде всего в Узбекистане, Таджикистане и среди народов, исторически связанных с регионом Средней Азии. Встречается и у татар, и у башкир, но реже — там более типична форма Мусабаев.

Интересна деталь: если бы фамилия образовывалась напрямую от арабского «Муса» без тюркского компонента, мы бы имели варианты вроде Мусаев или Мусин. Добавка «бай» — маркер социального контекста: в дореволюционной Средней Азии «баями» называли зажиточных людей, купцов, землевладельцев. Поэтому предок носителя фамилии Мусабоев, скорее всего, был не просто человеком по имени Муса, а человеком, которого в общине выделяли как уважаемого, состоятельного, «бая». Фамилия фиксирует не только имя, но и общественное положение родоначальника.

В русском написании возможна путаница с фамилией Мусабоев (через «о» после «б») — это один из вариантов транслитерации, встречающийся в документах. Но обе формы восходят к одному корню и означают одно и то же: «сын (потомок) Мусабая».