Фамилия Мусин в большинстве случаев — это отчество, образованное от уменьшительной формы имени Моисей. Муся — так на Руси ласково называли мальчиков, нареченных в честь библейского пророка, чье имя переводят как «спасенный из воды» или «вынутый из воды». Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мусин буквально значит «сын Муси», то есть потомок человека, которого звали Муся. Эта словообразовательная модель — одна из самых распространенных в русских фамилиях, и она не требует иных объяснений для основной массы носителей.

Однако у этой фамилии есть и другая, не менее интересная линия происхождения. В дворянской среде, а точнее в роду графов Мусиных-Пушкиных, основой послужило имя Муса — арабская и тюркская форма того же библейского Моисея. В переводе с древнеегипетского это имя иногда трактуют как «дитя», хотя более точная этимология спорна. Именно так, через татарское или иное восточное имя, образовалась знаменитая фамилия Мусин-Пушкин. Александр Сергеевич Пушкин обыграл эту двойственность в стихотворении «Моя родословная»: «Я Пушкин просто, не Мусин, я не богач, не царедворец, я сам большой, я мещанин». Поэт иронизировал над тем, что его род не принадлежал к графской ветви, которая вела происхождение от некоего Мусы.

Существует и третья версия, более экзотическая и менее вероятная, но оттого не менее любопытная. Она возводит прозвище Муса к древнерусскому слову «мусия», которым называли мозаику. В этом случае Мусой могли прозвать мастера, искусного в изготовлении мозаичных картин — ремесло редкое и почитаемое. Однако против этой гипотезы говорит то, что прозвища от названий профессий обычно образовывались напрямую: Мозаичник, Мусейщик, но не Муса. Скорее всего, здесь мы имеем дело с народной этимологией, которая притянула созвучное слово к уже готовому имени.

Наконец, отдельные исследователи связывают прозвище Муса с диалектными словами «мусак» или «мусат». В разных говорах так могли называть бродягу, странника или человека, который много ходит по свету. Если принять эту версию, то предок Мусиных мог быть паломником или торговцем, исходившим города и веси. Но и здесь стоит помнить: имя Муса, как и Муся, существовало самостоятельно и задолго до того, как обросло прозвищными смыслами.

Какую версию считать основной? Для подавляющего большинства современных Мусиных — первую, от уменьшительного Муся. Она проще, естественнее и не требует допущений. Восточный след и прозвищные значения — удел отдельных родов, вроде графов Мусиных-Пушкиных, или же позднейшие переосмысления. Так или иначе, фамилия Мусин — это типичное русское отчество, которое через цепочку поколений донесло до нас имя далекого предка, жившего несколько столетий назад.