Фамилия Мускеев — редкий пример, где основа почти наверняка связана с тюркским миром, а суффикс — с русской адаптацией. Разбираем её без натяжек.

Самый вероятный источник — тюркское мужское имя Муске (Муска, Мускей). В основе лежит арабское «муса» (Моисей), которое через тюркские языки дало множество вариантов: Муса, Мусабек, Мусаев. Форма Муске (с характерным для казахского, башкирского или татарского языков суффиксом -ке/-кей, указывающим на уменьшительность или ласкательность) и дала начало фамилии. Значение прозвища или имени — «маленький Муса», «Муса-батюшка».

Суффикс -ев присоединился к основе на мягкий согласный (Муске-ев), указывая на принадлежность: «сын Муске». Это типичная модель для русских фамилий, которые возникали у крещёных татар, башкир или других народов Поволжья. Географически фамилия встречается в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане — регионах, где веками шёл активный этнический и языковой контакт.

Версия с русским прозвищем от слова «мускус» (душистое вещество) маловероятна: такое прозвище не зафиксировано в исторических источниках, а корень «муск» для русского уха нехарактерен. Также не стоит связывать фамилию с «муской» (др.-рус. «муха») — это дало бы форму Мухин, а не Мускеев.

Таким образом, Мускеев — потомок человека по имени Муске, скорее всего, из тюркской среды, принявшей православие. Фамилия сохранила в себе звучание исходного имени, почти не изменившись за несколько веков.