Фамилия Муссагалиева восходит к двум мусульманским мужским именам: Мусса и Гали. Первое из них образовано от древнееврейского слова «мешу», которое имеет значение «дитя, ребенок». Имя Муса имеет различные формы: Моисей (у русских), Мозе (у немцев), Мозес (у англичан), Моиз (у французов). Имя Гали является одним из эпитетов Аллаха и в переводе с арабского означает «великий, возвышенный, высший, наивысший; высокопоставленный; дорогой; мощный, сильный, могущественный», «превосходящий над всеми». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Муссагалиевых можно лишь на основании генеалогических исследований.