Фамилия Мусагалиева — это отчество, образованное от мужского тюркского имени Мусагали. Такую фамилию получил потомок человека, которого звали Мусагали, и она передавалась из поколения в поколение, сохраняя память о семейных корнях. Само имя Мусагали составное, и каждая его часть несет отдельный смысл.

Первая часть восходит к имени Муса. Это еврейско-арабское имя, которое в мусульманской традиции считают вариантом древнееврейского имени Моисей. В переводе оно означает «ребенок, сын». Вторая часть — Гали — имеет арабские корни и переводится на русский язык как «высший, высокий, великий, дорогой», а также «превосходящий над всеми». Сложносоставные имена, где соединялись два разных имени или имени и титула, были широко распространены у тюркских народов, поэтому появление имени Мусагали — закономерный шаг в этой традиции.

Модель образования фамилии проста и характерна для русскоязычной среды: к основе Мусагали добавили патронимический суффикс -ев (после мягкого согласного), а форма Мусагалиева указывает на женскую линию рода или принадлежность жены. Мужской вариант — Мусагалиев.

Носители фамилии встречаются преимущественно в регионах проживания тюркских народов — в Поволжье, на Урале, в Казахстане и Средней Азии, что соответствует географии распространения исходного имени.