Фамилия Мустиева — женская форма, а её мужской вариант — Мустиев. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать основу. Корень «муст-» в русских и соседних славянских говорах имеет несколько значений, и самое вероятное связано с диалектным словом «муст» — так в некоторых областях называли кислое молоко, простоквашу или, шире, сыворотку. Прозвище Муст мог получить либо тот, кто делал и продавал такой продукт, либо, в переносном смысле, человек с кислым, ворчливым характером — «кислый» как простокваша.

Суффикс «-ев» указывает на типичную модель образования русских фамилий от прозвищ, основ которых не было в крестильных святцах. По этой же схеме возникли фамилии Кислов, Простоквашин, Сметанин — все они восходят к пищевым прозвищам. Фамилия Мустиев стоит в том же ряду, но встречается реже, что делает её более локальной.

Версия о тюркском происхождении менее правдоподобна. В тюркских языках есть слово «муста» (свободный, независимый), но оно дало бы иное окончание — например, Мустаев или Мустафьев. Фонетически «Мустиев» ближе к славянской модели, чем к арабско-тюркской основе.

Географически фамилия Мустиева встречается в записях по югу России и Поволжью — регионам, где были развиты молочное хозяйство и сыроварение. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, связанными с переработкой молока, и их прозвище закрепилось как родовое имя.