Фамилия Мустиев — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять корень, нужно отбросить типичный русский суффикс -ев, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Мустия). Вся смысловая нагрузка ложится на основу Мусти-.

Здесь возможны два основных пути, и первый — самый вероятный. Мустий — это фонетический вариант крестильного имени Мустафа (арабское «избранный»). В тюркской и мусульманской среде, особенно у татар и башкир, имя Мустафа было широко распространено. При переходе в русскую среду через перепись или метрическую книгу имя могли записать на слух как «Мустий» (с заменой «ф» на глухую пару или с упрощением), а затем по стандартной модели образовали фамилию Мустиев. Подтверждает эту версию и география: фамилия встречается в Поволжье и на Северном Кавказе, где исторически сильны тюркские и кавказские корни.

Вторая версия, менее распространённая, отсылает к латинскому корню. В римском именослове было родовое имя Mustius (Мустий). Однако эта линия для русской фамилии — экзотика. Такие фамилии могли появиться у выпускников духовных семинарий, где любили давать «учёные» фамилии на латинский манер, или у обрусевших дворян, но для Мустиева это скорее гипотеза без массовых подтверждений.

Суффикс -ев указывает на то, что фамилия формировалась в среде, где преобладала модель отчества на -ев (а не, скажем, украинский -енко или польский -ский). Это типично для центральной России и южных регионов, где смешивались русские и тюркские традиции имянаречения.

В дореволюционных источниках фамилия могла писаться через «а» — Мустаев, что также подтверждает связь с именем Мустафа. Сословно носители Мустиева, скорее всего, были государственными крестьянами или однодворцами — не дворяне, но и не крепостные. Ярких исторических фигур с этой фамилией не зафиксировано, что типично для фамилий, возникших из личного имени в среде простого народа.