Фамилия Мутигуллина — редкий случай, когда на слух почти не чувствуется её татарская основа, хотя она перед нами. Это женская форма, а мужской вариант — Мутигуллин. Корень здесь — арабское имя Мутигулла, что в переводе означает «покорный Аллаху» или «послушный Богу». В мусульманском именослове такие имена с частицей «гулла» (от «Аллах») типичны и распространены у татар, башкир и других тюркоязычных народов, исповедующих ислам.

Образование фамилии пошло по классической для Поволжья модели: к основе имени добавили русский патронимический суффикс -ин (как в фамилиях Пушкин, Репин). Получилось Мутигуллин — «сын Мутигуллы». Это говорит о том, что предки носителя фамилии жили в зоне активного русско-татарского культурного контакта, скорее всего, на территории современных Татарстана или Башкортостана, где в XVIII–XIX веках при переписях татарским родам массово давали фамилии по отцу с русскими окончаниями.

Интересная деталь: в отличие от более частых фамилий на -ов (Мутигуллов), суффикс -ин здесь не случаен. Он закрепился за основами, оканчивающимися на гласный или мягкий согласный, и в данном случае подчеркивает, что исходное имя звучало именно как Мутигулла, а не, скажем, Мутигул. Это делает фамилию более точным слепком с живого произношения предка.

Сословно носители такой фамилии вряд ли принадлежали к дворянству. Скорее всего, это были государственные или ясачные крестьяне, ремесленники, а возможно, и муллы — люди, чьё имя прямо указывало на религиозное благочестие. Сведений о массовом распространении фамилии за пределами Волго-Уральского региона нет, что подтверждает её локальный, «семейный» характер.