Фамилия Мутыров — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от «профессиональных» фамилий вроде Кузнецовых или Плотниковых, она, скорее всего, восходит к прозвищу или к мирскому имени.

Самый вероятный источник — диалектное слово «мутырь». В центральных и южнорусских говорах так называли беспокойного, суетливого человека, который постоянно «мутит воду», вносит смуту или просто крутится под ногами. Реже «мутырём» могли назвать мутную, непрозрачную жидкость или, в переносном смысле, путаника, сбивающего других с толку. Таким образом, основатель рода Мутыровых, скорее всего, получил это прозвище за свой беспокойный нрав или склонность к интригам.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую патронимическую модель: «чей?» — «Мутыров», то есть сын или потомок Мутыря. Фамилия образована по тому же принципу, что и Петров (от Пётр) или Козлов (от Козёл), только в основе лежит не имя, а прозвище.

Есть и менее очевидная, но лингвистически возможная версия. В некоторых регионах слово «мутырь» могло быть искажённой формой тюркского имени или термина, связанного с корнем «мут» (смелость, отвага). Однако для русского уха эта связь неочевидна, и версия с прозвищем по характеру — основная и самая правдоподобная.

Географически фамилия встречается разрозненно, без ярко выраженного «гнезда». Её носители есть и на юге России, и в Поволжье, что косвенно подтверждает широкое бытование диалектного слова. В дореволюционных источниках фамилия не фиксируется среди дворянства или купечества первой гильдии — это указывает на крестьянское или мещанское происхождение большинства Мутыровых, чьи предки получили фамилию при отмене крепостного права в XIX веке.