Фамилия Музагитов образована от тюркского мужского имени Музагит, которое в переводе с арабского означает «старающийся, усердный», «борец за религию, защитник народа». Вероятно, родители, нарекая ребенка таким именем, как Музагит, желали своему сыну стать достойным мусульманином. Таким образом, потомок человека, которого звали Музагит, со временем получил фамилию Музагитов.