Фамилия Музенко — характерный пример украинской модели фамилий на -енко. Суффикс -енко в украинской ономастике — один из самых распространённых патронимических показателей, означающий «сын» или «потомок». Если Остап — Остапенко, то Музенко — потомок человека по имени или прозвищу Муза.

Но с основой сложнее. В русском и украинском языках слово «муза» — женского рода, а фамилии на -енко образовывали от мужских имён или прозвищ. Поэтому прямая версия «от имени Муза» маловероятна. Более правдоподобно, что в основе лежит прозвище Муза, которое мог получить человек за любовь к пению, игре на музыкальных инструментах или просто за мечтательный, вдохновенный характер. В украинских говорах слово «муза» могло употребляться иронично — в значении «капризный человек» или «фантазёр».

Есть и другая, более приземлённая версия. В южных и западных регионах бывшей Российской империи фамилию могли дать по профессии. В польском и украинском языках «muza» — это не только богиня искусства, но и музыка (от лат. musica). Соответственно, Музенко мог быть потомком музыканта, причём не обязательно профессионального — сельского скрипача или кобзаря. В пользу этой версии говорит то, что фамилия распространена в Черкасской и Полтавской областях — на землях, где традиция кобзарства была особенно сильна.

Географически Музенко — фамилия преимущественно левобережной Украины. По данным современных исследований, наибольшая концентрация носителей — в Черкасской области и в городе Киеве. В России фамилия встречается, но редко, и почти всегда у выходцев с Украины. Это косвенно подтверждает, что фамилия сформировалась именно в украинской языковой среде, а не была искусственно создана в канцеляриях.

Редкий суффикс -енко при женской основе — вот что делает Музенко необычной. Если бы фамилия была русской, она звучала бы как Музин (от Муза) или Музов (от Мус — сокращение от Мустафа в тюркских языках). Но украинская модель «от прозвища + -енко» дала именно такой вариант. Так что предки современных Музенко, скорее всего, были людьми творческих профессий или просто получили прозвище за весёлый нрав и любовь к песням.