Фамилия Музыкина образована от прозвища Музыка. В «Толковом словаре живого великорусского языка» Владимира Даля это слово определяется как «искусство стройного и согласного сочетания звуков, как последовательных (мелодия, напев, голос), так и совместных (гармония, соглас, созвучие)». Но за прозвищем стоял не абстрактный термин, а конкретный человек — скорее всего, музыкант. Такого человека на Руси выделяли не только за ремесло, но и за особый дар: издревле музыканту приписывали колдовские способности, умение влиять на настроение и даже судьбу людей. Поэтому прозвище Музыка закрепилось за ним как наиболее употребительное именование, вытеснив крестильное имя.

Словообразовательная модель здесь простая и распространённая: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть «Музыкина» буквально значит «дочь или жена Музыки». Мужской вариант — Музыкин — отвечал на вопрос «чей ты?» и означал «сын Музыки». Такие фамилии на -ин чаще всего возникали в северорусских и центральных говорах, где притяжательные прилагательные образовывались именно так. В южных и западных регионах предпочтение отдавали суффиксу -ов/-ев, поэтому форма Музыкин выдаёт вероятную географию предков — средняя полоса или Русский Север.

Стоит заметить, что прозвище Музыка могло закрепиться и за человеком, который не играл на инструментах, а, скажем, обладал громким голосом или любил петь. В народной среде прозвища часто давались по самой заметной черте, и музыкальность — не обязательно профессиональная — была такой чертой. Однако версия о ремесле музыканта остаётся основной: она подкрепляется словарным значением слова и тем, что в старых переписных книгах «музыками» называли именно скоморохов и игрецов, которые ходили по дворам и тешили народ.

Фамилия Музыкина не относится к числу древних боярских или дворянских родов — её носители, судя по модели образования, были людьми простого звания, крестьянами или посадскими. Передаваясь из поколения в поколение, она по сей день хранит память о происхождении индивида: о том, что его далёкий предок умел то, что доступно не каждому, — владел звуком и ладом.