Фамилия Мяткин образована от прозвища или нецерковного имени Мятка. В основе лежит слово «мята» — пахучее травянистое растение. Прозвище Мятка могли дать человеку, который торговал мятой, занимался её сбором или просто любил эту траву, добавлял её в еду и питьё. В русских говорах слово «мята» имело и переносное значение — так могли называть привередливого, капризного человека. Но это скорее местная, редкая трактовка.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Мяткин буквально значит «сын Мятки» или «человек из семьи Мятки». Модель типична для северных и центральных русских областей, где фамилии на -ин широко распространены. По сословному составу Мяткины — почти наверняка крестьянская или мещанская фамилия. Дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не отмечено.

В ономастике фамилия Мяткин не вызвала споров: все исследователи сходятся на растительном корне. Есть и однокоренные фамилии — Мятников, Мятов, Мятин. Но Мяткин встречается заметно чаще, особенно в Вологодской, Костромской и Архангельской областях. География подтверждает северное происхождение: именно в этих краях мяту использовали как пряность и лекарство особенно активно, а прозвища по занятиям и пристрастиям давали охотно.

В XIX веке фамилия Мяткин встречается в метрических книгах и ревизских сказках как рядовая крестьянская. Никаких громких исторических личностей с ней не связано, и это нормально: большинство русских фамилий именно такие — бытовые, прозрачные по смыслу, рассказывающие о занятии или вкусах далёкого предка.