Фамилия Мысютин — один из тех случаев, когда на слух кажется, что корень очевиден, а на деле всё сложнее. Самое прямое предположение — связь с «мысом» или «мыслить» — лингвисты отвергают почти сразу. Основа здесь не географическая и не интеллектуальная, а личная: в её основе лежит уменьшительная форма имени или прозвища.

Разбираем фамилию по составу. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Мысютин. Значит, был человек (вероятно, отец или дед), которого звали Мысюта. А это, в свою очередь, ласкательно-уменьшительная форма от крестильного имени Мисаил (древнееврейское «испрошенный у Бога»). В народной речи Мисаил превращался в Мисю, Мисюту, Мысюту — так же, как Михаил давал Мишуту, а Даниил — Данюту. Фамилии на -юта/-ютин (Мысютин, Мисютин, Данютин) характерны для северных и центральных областей России, где такие «усечённые» формы имён были особенно в ходу.

Есть и вторая, менее распространённая версия. В некоторых говорах слово «мысюта» или «мисюта» могло быть прозвищем для человека маленького роста, невзрачного или суетливого — что-то вроде современного «мелюзга». Слово это родственно диалектному «мизюрить» (плохо видеть, щуриться) и «мизгирь» (паук, мелкое существо). В этом случае фамилия произошла не от имени, а от прозвища по внешности или характеру. Но первая версия — от имени Мисаил — считается основной, поскольку она вписывается в типичную для русских фамилий модель «каноническое имя → уменьшительная форма → фамилия».

Интересно, что фамилия Мысютин встречается в двух вариантах написания: через ы и через и (Мисютин). Оба варианта исторически равноправны и восходят к одному корню, просто в разных регионах «ыканье» или «иканье» закрепилось в документах. Сейчас форма с «ы» чуть реже, но она ничуть не менее «правильная» — это просто живая память о том, как звучало имя предка в той местности, где фамилия записалась впервые.