Фамилия Мызенков образована от прозвища Мыза. Оно восходит к аналогичному нарицательному, значение которого В.И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет следующим образом: «дача, отдельный загородный дом с хозяйством, хутор». Вероятно, прозвище Мыза содержало указание как на особенности места жительства основателя фамилии (за городом), так и на род его деятельности (сельское хозяйство). Согласно другой гипотезе, прозвище Мыза имеет схожую этимологию с украинским прилагательным «мизатый» - «толстощекий». В таком случае прозвище Мыза могло быть дано полнолицему, упитанному человеку. Со временем, вероятно, род Мызенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. Так и прозвище Мыза закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Мызенков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мыза, со временем получил фамилию Мызенков.