Фамилия Наджимудинов — одна из тех, что прямо указывает на арабское происхождение, но при этом имеет ярко выраженный русский «отпечаток» в виде суффикса -ов. Это типичная фамилия, образованная по модели «имя отца + суффикс принадлежности». В основе лежит сложное арабское мужское имя Наджимудин, которое состоит из двух корней: «наджм» (звезда) и «дин» (вера, религия). Вместе это означает «звезда веры» — распространённый тип мусульманских имён с религиозным подтекстом, аналогичных, например, Нуруддину (свет веры) или Сайфуддину (меч веры).

Фамилия Наджимудинов могла возникнуть в среде тюркских или кавказских народов, исповедующих ислам, где арабские имена были и остаются популярными. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия русифицировалась: её носителями, скорее всего, были люди из регионов, вошедших в состав Российской империи, — татары, башкиры, народы Дагестана или Чечни. В метрических книгах или переписях XIX века имя Наджимудин, а затем и фамилия Наджимудинов, фиксировались как отчество: «сын Наджимудина». Со временем это закрепилось в качестве родового имени.

Интересно, что в отличие от многих арабских заимствований, где ударение часто падает на последний слог, в фамилии Наджимудинов ударение, как правило, ставится на третий слог с конца — Наджиму́динов, по законам русской фонетики. Встречаются и варианты написания с одной «д» (Нажимудинов) — это результат упрощения произношения в некоторых диалектах. Если искать однокоренные параллели, то можно вспомнить фамилию Наджимов (от более короткой формы имени Наджим), но Наджимудинов — более полная и редкая форма, сохранившая имя-основу целиком.

Социальная принадлежность предков-носителей этой фамилии не была строго фиксированной. Встречались как крестьяне и ремесленники, так и представители мусульманского духовенства — муллы или учителя медресе, ведь имя «звезда веры» часто давали людям, от которых ждали религиозного рвения. В современной России фамилия Наджимудинов нечастотна, но встречается преимущественно в Поволжье и на Северном Кавказе, а также в среде татарской и дагестанской диаспоры.