Фамилия Нафидин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от распространённых фамилий на -ов и -ин, образованных от крестильных имён, здесь мы имеем дело с более сложной и, вероятно, поздней моделью.

Ключ к разгадке — конечная часть -ин. Это типичный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «чей?» — Нафидин, то есть сын (или потомок) человека по имени Нафида. Но что это за имя? В русском именослове оно не встречается. Скорее всего, основа тюркская или арабо-персидская. Имя Нафид (или Нафида) может восходить к арабскому корню, связанному с понятиями «полезный», «приносящий пользу» (нафи‘). В таком случае фамилия буквально означает «сын полезного» или «принадлежащий тому, кто приносит пользу».

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — происхождение от прозвища. В некоторых тюркских языках слово «нафид» или близкие к нему формы могли обозначать нечто специфическое: род занятий, особенность характера или внешности. Однако без конкретных диалектных данных это остаётся лишь догадкой.

География фамилии говорит сама за себя. Нафидины — это не массовая фамилия. Её носители встречаются в регионах с сильным татарским и башкирским влиянием, а также в среде кавказских народов, где распространены имена арабского происхождения. Фамилия могла возникнуть в среде крещёных татар или в русско-тюркском пограничье, где имена адаптировались под русскую патронимическую систему.

Сама словообразовательная модель здесь необычна: фамилия на -ин, но основа не славянская. Это говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, был не русским по происхождению, но жил в русскоязычной среде, где его имя оформили по привычному образцу: «Иван → Иванов», «Нафида → Нафидин». В этом смысле фамилия — маркер культурного и языкового контакта.