Фамилия Наговицын (в женском роде — Наговицына) происходит от прозвища Ноговица, которое давали человеку, чем-то примечательному в глазах окружающих. Основа здесь — древнерусское слово «ногавица», означавшее род одежды или обуви, прикрывающей ноги: чулок, портянку, а иногда и штанину. Прозвище могли закрепить за мастером, который шил такую одежду, за человеком, носившим необычные ногавицы, или просто за тем, у кого была какая-то особенность походки или ног.

Модель образования типична для русских фамилий XV–XVII веков: к основе прозвища добавили притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность потомку. Сначала это звучало как «сын Наговицын», то есть «сын того, кого звали Ноговица», а затем закрепилось как родовое имя. Интересно, что в старых документах встречается и более ранняя форма без суффикса — Наговицын, и вариант с другим окончанием: например, в «Ономастиконе» С. Б. Веселовского упоминаются Ногавицын Василий Иванович (вторая половина XV века) и князь Петр Федорович Наговицын (1560 год). Эти записи показывают, что фамилия бытовала в разных слоях общества — и среди служилых людей, и среди княжеского рода.

Стоит различать написание: в современном употреблении чаще встречается форма «Наговицын», хотя в исторических источниках попадается и «Ногавицын» — с корневой «а» после «н». Дело в том, что безударная «о» в разговорной речи давно звучала как «а», и на письме это отражалось непоследовательно. Поэтому обе формы — родственницы, и обе ведут к одному прозвищу.

Точное место и время возникновения фамилии назвать сложно: процесс становления родовых имен в разных регионах растянулся на столетия. Но сам факт, что фамилия встречается в документах уже в XV веке, говорит о её древности. Носители фамилии Наговицыны — это потомки человека, которого в старину прозвали Ноговицей, и в этом имени, как в капле, сохранилась память о быте и языке наших предков.