Фамилия Нагзибеков — редкий пример тюркско-иранского гибрида в русском ономастиконе. Её основа — составное личное имя Нагзибек, где первая часть «нагз» восходит к персидскому «нагз» (نغز) — «хороший, прекрасный», а вторая — тюркский титул «бек» (князь, господин). Таким образом, имя Нагзибек означало «прекрасный бек» или «добрый господин» — типичная для мусульманского Востока хвалебная антропонимная формула, призванная пожелать носителю благородства и удачи.

Русский суффикс -ов превратил имя отца в фамилию сына: Нагзибеков — «потомок Нагзибека». По модели образования фамилия стоит в одном ряду с Алибековым, Мурзабековым, Узбековым, но отличается редкостью корня «нагз». В отличие от ходовых арабских или чисто тюркских компонентов, персидское «нагз» в русских фамилиях почти не встречается, что делает Нагзибекова скорее маркером определённой региональной или этнической группы.

Географически фамилия тяготеет к Северному Кавказу и Закавказью, особенно к Дагестану и Азербайджану, где персидские заимствования в тюркских языках — обычное дело. Предки современных Нагзибековых скорее всего были из числа горских народов, принявших ислам и усвоивших арабо-персидскую культуру именования. Сословно фамилия не указывает на дворянство: «бек» здесь не столько титул, сколько компонент имени, распространённый среди свободных общинников и узденей.

Любопытная деталь: в дореволюционных метрических книгах фамилию могли записывать как Нагзибеков, Нагзыбеков или даже Накзибеков — из-за неустойчивой передачи персидской фонетики кириллицей. В современной России фамилия остаётся малочисленной, но её носители могут проследить свою родословную до конкретного предка, носившего редкое имя со значением «прекрасный князь».