Фамилия Нахаретян — типичный пример армянской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -ян. Этот суффикс, восходящий к древнему -янц, указывает на принадлежность к роду или потомку по мужской линии. В русском языке такие фамилии закрепились в форме с окончанием -ян, хотя в самой Армении распространены варианты на -янц.

Основа фамилии — Нахарет. Скорее всего, это армянское личное имя или прозвище. Наиболее убедительная версия связывает его с армянским словом «нахарак» (арм. «нахарар» — князь, вельможа, представитель высшей знати в древней и средневековой Армении). В таком случае Нахаретян означает «потомок нахарара» или «из рода князей». Однако стоит сделать оговорку: прямое указание на княжеское происхождение в фамилии необязательно означает реальное дворянство предков. Прозвище Нахарет могли дать и человеку с важной осанкой, строгим нравом или просто тому, кто служил у знатного господина.

Менее распространённая версия выводит основу из диалектного варианта имени Нахапет (арм. «нахапет» — глава, предводитель). В таком случае фамилия означала бы «потомок главы» или «сын старшего». Оба варианта — и с «нахараром», и с «нахапетом» — указывают на социальное положение или уважительное прозвище родоначальника, а не на ремесло или географию.

Фамилия Нахаретян распространена в среде армян как из Западной Армении (исторические области, ныне на территории Турции), так и из Восточной. Встречается она и в России, куда попала с волнами миграции XIX–XX веков. В написании возможны варианты: Нахаретян, Нахаретян, Нахаратян — разница в огласовке корня, что характерно для передачи армянских звуков кириллицей. В дореволюционных документах фамилия могла фиксироваться как Нахаретъянцъ.