Фамилия Налтаев — редкая и с неочевидной этимологией. Чтобы понять её корни, нужно разобрать словообразовательную модель. Основа «Налтай» и суффикс «-ев» указывают на то, что фамилия образована от личного имени или прозвища Налтай. Суффикс «-ев» в русских фамилиях означает принадлежность («чей?»), поэтому Налтаев — это «сын Налтая» или «потомок Налтая».

Самая вероятная версия связывает основу с тюркскими языками. В них слово «нал» (с разными огласовками) может означать «подкова» или «кольцо». «Налтай» в таком случае — это человек, имеющий отношение к подковам: кузнец, коновал или просто владелец приметной подковы. Вторая версия, менее распространённая, отсылает к тюркскому «нал» в значении «драгоценный камень» или «самоцвет». Тогда прозвище Налтай могли дать человеку с яркими, «сверкающими» глазами или дорогим украшением.

С точки зрения географии, фамилия Налтаев наиболее характерна для регионов с сильным тюркским субстратом: Поволжье (Татарстан, Башкортостан), Южный Урал и отчасти Казахстан. Встречается она и у русских, но в таких случаях, скорее всего, отражает давние контакты с тюркоязычными соседями, когда прозвище вошло в обиход и закрепилось как фамилия.

Сравнение с однокоренными фамилиями, такими как Налтанов или Налтаков, показывает, что все они восходят к одному корню, но различаются по суффиксам, характерным для разных регионов. Налтаев — форма, типичная для русской адаптации тюркских имён. Таким образом, предки Налтаевых, скорее всего, были людьми, связанными с ремеслом или выделявшимися какой-то внешней приметой, а сама фамилия сохранила память о тюркском слове, ушедшем из активного употребления.