Фамилия Нарубень звучит так, будто её носитель когда-то имел прямое отношение к рубке леса. И это первая и самая очевидная версия: в основе лежит глагол «рубить» с приставкой «на-». Прозвище Нарубень могли дать лесорубу, дровосеку или человеку, который занимался заготовкой строительного леса. В говорах «нарубить» означало не просто срубить, а наготовить впрок, нарубить дров. Так что предок мог быть человеком работящим и хозяйственным.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. В русских фамилиях гораздо чаще встречается суффикс -ов/-ев (Нарубнев) или -ин (Нарубин). Формант -ень — редкий, он больше характерен для украинской и белорусской ономастики. В украинском языке суффикс -ень образует существительные со значением лица по действию (например, «рубач» — «рубень», «стрижень»). Таким образом, фамилия Нарубень с высокой вероятностью имеет западнорусское, белорусское или украинское происхождение. Географически её стоит искать в южных и западных областях России, а также в Беларуси.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с прозвищем, данным за внешность или характер. В диалектах «нарубнем» могли назвать коренастого, плотного человека, как бы «рубленого». Однако эта версия слабее: прозвища по внешности обычно образуются через другие суффиксы.

Встречается ли фамилия в исторических документах? Данных о массовом распространении Нарубень нет. Это редкая фамилия, что подтверждает её локальный характер. Скорее всего, она возникла в одном-двух селениях и не разошлась широко. Сравните с однокоренными: Нарубин (тульские и рязанские земли) или Нарублев (связь с топонимом). Нарубень стоит особняком — как раз из-за того редкого суффикса.

Итог простой: ваш предок, скорее всего, был лесорубом или плотником в белорусских или украинских землях. Фамилия не дворянская, не купеческая — самая что ни на есть рабочая, крестьянская. И в этом её честность.