Фамилия Наволочный звучит как прилагательное, но её мужская форма скрывает за собой либо прозвище, либо профессиональное имя, а не прямое указание на предмет обихода. В основе лежит слово «наволока» или «наволочка» — в старом русском языке так называли не только чехол для подушки, но и покрывало, а в некоторых говорах — верхнюю одежду вроде накидки или мешковатого плаща. Человек, получивший прозвище Наволока, мог быть портным, торговать постельным бельём или просто носить заметную верхнюю одежду, за которую его и прозвали.

Суффикс -ный в фамилиях встречается реже, чем стандартные -ов или -ин, и обычно указывает на адъективное происхождение — то есть фамилию дали как готовое прилагательное, без добавления притяжательного суффикса. В украинской и белорусской традиции такие формы (Наволочний, Наволочный) встречаются чаще, чем в великорусской. В русском быту фамилия могла закрепиться через семинарскую среду: священники нередко получали фамилии от бытовых предметов или явлений, и «Наволочный» — один из таких «обиходных» вариантов.

Географически фамилия тяготеет к юго-западу России и Украине. В переписях XIX века носители встречаются в Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниях, что говорит о возможном украинском или смешанном происхождении. В некоторых случаях фамилия могла возникнуть от названия местности — «Наволок» или «Наволочная» (деревня, расположенная на мысу, наволоке — наносной земле у реки). Тогда Наволочный — это человек, пришедший из такого села.

Есть и менее очевидная версия: в архангельских говорах «наволока» означала туман, влажный воздух над водой. Если предок жил в сырой низине или у реки, его могли прозвать Наволокой — «туманным», «промозглым». Но эта гипотеза слабая, потому что прозвища по природным явлениям редко становились фамилиями без дополнительного контекста. Правдоподобнее всего — ремесло или место жительства.