Фамилия Найдёнкин произошла от мирского имени Найдёнка, которое родители давали ребенку с целью уберечь его от нечистой силы. Обычай был таким: отец или дед выносил больного ребенка из избы, а через некоторое время приносил его обратно, называя не прежним именем, а Найдёнком или Ненашем. Считалось, что бесы, услышав, что это уже другой ребенок, отступятся от него. Потомок человека с именем Найдёнка со временем и получил фамилию Найдёнкин.

Подобная модель образования фамилий — через суффикс -кин — типична для русских фамилий, возникших от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Суффикс -кин здесь указывает на принадлежность: Найдёнкин означает «сын Найдёнки». Это же имя встречается и в основе других фамилий, например Найдёнов или Найдёнышев, что подтверждает его распространённость в крестьянской среде.

Мирское имя Найдёнка относится к группе «охранительных» имён, которые давали не при крещении, а в быту, чтобы обмануть злые силы. Такие имена, как Ненаш, Найден, Неждан, были широко распространены в дохристианской традиции и сохранялись в деревенском обиходе вплоть до начала XX века. В документах того времени упоминается, например, Найдёнкин Иван Алексеевич, родившийся в 1899 году в Воронежской области, в селе. Эта запись — редкое документальное свидетельство бытования фамилии именно в южнорусских губерниях, где обычай давать охранительные имена держался особенно долго.

Стоит отметить, что фамилия Найдёнкин не имеет отношения к глаголу «найти» в прямом смысле, то есть к подкидышам или найденным детям. Хотя такая версия кажется логичной, она не подтверждается историческими данными: имя Найдёнка в народной традиции означало именно «обретённого» ребёнка, которого символически заново нашли после обряда. Поэтому говорить о том, что предки носителей фамилии были подкидышами, нет оснований. Правдоподобнее выглядит связь с обрядовым переименованием, которое должно было защитить младенца от болезней и сглаза.

Фамилия Найдёнкин — редкая, и её носители сегодня встречаются в основном в центральных и южных областях России, что согласуется с историей её возникновения в крестьянской среде. Несмотря на редкость, она хорошо сохранила свою внутреннюю форму: любой носитель фамилии может объяснить её происхождение, даже не будучи историком, — настолько прозрачна её связь с народным обычаем, уходящим корнями в глубокую древность.