Фамилия Неаполитанова звучит экзотично для русского уха, но её происхождение прозрачно и связано не с итальянским Неаполем напрямую, а с церковной или семинарской традицией. Основа фамилии — топоним «Неаполь» (итальянский город Napoli, в латинской и греческой традиции — Neapolis). В России такие «географические» фамилии давали не по месту жительства, а по учебному заведению: в духовных семинариях и академиях существовала практика присваивать будущим священникам звучные фамилии в честь библейских городов, святых мест или античных центров. Неаполь, как древний христианский город, вполне мог стать источником для такой семинарской фамилии.

Суффикс -ов- указывает на типичную русскую модель образования: от основы «Неаполитан» (то есть «житель Неаполя» или «относящийся к Неаполю») с помощью притяжательного суффикса, перешедшего в фамильный. Форма женского рода Неаполитанова — это либо жена, либо дочь мужчины с фамилией Неаполитанов. В русской традиции такие фамилии на -ов/-ев закрепились за духовным сословием, и Неаполитанов — не исключение. Вероятнее всего, первый носитель этой фамилии, студент семинарии, получил её как «украшение» — красивую, книжную, отсылающую к классической древности.

Менее вероятная, но возможная версия — прозвище Неаполитанец, которое могли дать человеку, побывавшему в Италии или имевшему дело с итальянцами (например, купцу или моряку). Однако для XVIII–XIX веков, когда формировалась масса русских фамилий, такая история была бы уникальной: простые люди редко путешествовали так далеко, а дворяне, бывавшие в Европе, обычно сохраняли родовые фамилии. Семинарский след надёжнее.

Что касается географии: фамилия Неаполитанов (и её женская форма) редкая, но встречается в центральной России и Поволжье, в регионах, где были сильные духовные школы (например, в Тверской, Ярославской, Костромской губерниях). В документах XIX века её носители — в основном священно- и церковнослужители, их жёны и дети. В советское время фамилия потеряла сословную привязку, но сохранила книжный, немного старомодный оттенок. Сегодня она может принадлежать людям, чьи предки были из духовного сословия, или тем, кто унаследовал её по женской линии.