Фамилия Недоходов — один из тех случаев, когда прозвище, ставшее фамилией, говорит о социальном или экономическом положении человека. В её основе лежит слово «недоход» — нехватка, убыток, неполученная прибыль. В русских говорах «недоходом» называли и неудачливого хозяина, у которого дела шли плохо, и того, кто жил впроголодь, «не доходил» до достатка. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, получил прозвище за бедность или хроническую неудачливость в промысле.

Модель образования проста и типична для русских фамилий: суффикс -ов присоединяется к основе «Недоход». Такая модель закрепилась за потомками в Северо-Восточной Руси (будущие центральные и северные губернии) и указывает на патроним — «сын Недохода». Важно, что в слове нет суффикса -н-, который мог бы указывать на прилагательное (как в фамилии Недоходный), — это именно прозвищная основа, а не описание места жительства или ремесла.

В ономастических источниках фамилия Недоходов встречается редко, что говорит о её преимущественно локальном бытовании. Сравните с однокоренными Недошивин («плохой швец»), Недосекин («недосек в лесу»), Недоборов — все они построены по одной модели: отрицание «не-» плюс существительное, обозначающее недостаток. Географически фамилия могла закрепиться на Урале или в Сибири, куда переселенцы приносили прозвища из центральных областей.

Сложность в том, что «недоход» могло быть не только прозвищем, но и термином. В некоторых промыслах (например, в лесном деле или на мельницах) «недоходом» называли невыполнение нормы или недобор продукции. Если предок был, скажем, мельником или рудокопом, прозвище могло привязаться к нему за систематическую нехватку выработки. Однако социальная окраска — бедность, неудача — остаётся главной версией.

Фамилия сохранилась в современной России, но не входит в число распространённых. Носители Недоходова могут найти корни в Вологодской, Кировской или Пермской областях — регионах, где активно использовались «отрицательные» прозвища, описывающие жизненные обстоятельства, а не личные качества.