Фамилия Немойкин образована от прозвища Немойка. Вопреки интуитивному ожиданию, речь идет не о человеке, лишенном дара речи: в старину прозвище Немой нередко давали не столько за физический недуг, сколько за молчаливость, неразговорчивость или даже застенчивость. Впрочем, и прямая связь с немотой как болезнью полностью исключать нельзя — прозвища часто фиксировали самую заметную черту человека, какой бы она ни была.

Разбор фамилии показывает редкую для наших мест словообразовательную модель. Суффикс -кин указывает на принадлежность: Немойкин — это «сын Немойки», где Немойка — уменьшительно-ласкательная форма прозвища Немой. Такая модель с суффиксом -ка и последующим притяжательным -ин характерна скорее для северных и центральных русских говоров, а также для белорусского и украинского именослова. В южнорусских и западнославянских землях чаще использовали бы форму Немойков или Немойович, поэтому написание через -кин может служить косвенным указанием на географию предков.

Именования, образованные по той же модели, что и фамилия Немойкин, широко представлены в ономастике восточных, западных и южных славян. Славянские фамилии возникали от личного прозвища или от имени (христианского или языческого). В данном случае основа — чисто славянское прозвище, без церковного календарного имени. Интересно, что корень «нем-» в древности имел более широкое значение, чем сейчас: «немой» означало не только «не говорящий», но и «непонятно говорящий», «иностранец», «чужак». В некоторых диалектах так могли прозвать человека с невнятной речью или того, кто говорил на чужом наречии.

Правдоподобнее выглядит версия о прозвище за характер: молчальников на Руси уважали, но редко оставляли без внимания — меткое прозвище прилипало быстро и передавалось детям. Уже к XVII веку форма Немойка встречается в писцовых книгах как личное прозвище, а к XVIII-XIX векам от нее закономерно образовалась фамилия Немойкин. Слабая альтернативная гипотеза, возводящая фамилию к имени Немой (якобы охранительное имя, которое давали, чтобы отвести беду), не находит серьезной поддержки в источниках: охранительные имена строились по другой модели — чаще с отрицанием «не» в начале, например Некрас или Неждан.

Сегодня фамилия Немойкин встречается нечасто, но стабильно бытует в Поволжье и в некоторых областях Центральной России. Среди известных носителей нет громких исторических фигур, однако это не умаляет ценности фамилии: она сохранила редкую словообразовательную архаику и точный портрет предка — человека, которого окружающие запомнили как тихого, немногословного, возможно, замкнутого.