Основой фамилии Неплюев послужило мирское имя Неплюй. Нецерковное имя Неплюй восходит к слову «неплюй» - «олений теленок до полугода». Давая младенцу такие имена, как, например, Волк, Белка, Неплюй, Калина, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Веселовского упоминаются: Федор Иванович Неплюй Кобылий, начало XV в.; Иван Кузьмич Неплюй Бровцын, 1550 г. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Неплюй, со временем получил фамилию Неплюев.