Фамилия Неплюхина — женская форма фамилии Неплюхин. Её основа — прозвище Неплюха, которое в русских говорах имело нелестное значение. В словаре Владимира Даля «неплюха» — это неряшливый, неопрятный человек, грязнуля. Прозвище давали тому, кто ходил нечисто, не следил за собой или за хозяйством. Слово образовано от глагола «плюхать» — пачкать, делать небрежно, с добавлением отрицательной приставки «не-». В итоге «неплюха» — это не столько «тот, кто не пачкает», сколько человек, который «не может не пачкать» или «пачкает постоянно».

Фамилия образована по стандартной для русских фамилий модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: Неплюхин — сын Неплюхи. Такая модель типична для центральных и северных регионов России. Встречается фамилия в основном в Поволжье и на Урале, что подтверждается данными переписей XIX века. В документах XVII века уже упоминаются крестьяне Неплюхины в Арзамасском и Курмышском уездах.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на -ухин, которые образованы от канонических имён (например, Андрюха — Андрюхин), основа Неплюха — чисто бытовое, нецерковное прозвище. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был, скорее всего, крестьянином или посадским человеком, а не дворянином. В дворянской среде такие «обидные» прозвища закреплялись редко — их старались заменить на более благозвучные формы.

Однокоренные фамилии — Неплюев, Неплюй. У них схожая логика: прозвище от глагола «плевать» или «плюхать». Но Неплюхин стоит особняком: суффикс -ух- в основе придаёт слову оттенок снисходительно-пренебрежительной характеристики. В говорах «неплюха» могло звучать и как шутливое прозвище неловкого ребёнка, которое потом закрепилось за целым родом.