Фамилия Неплюев принадлежит к древнему пласту русских родовых именований, образованных от мирских, то есть нецерковных, имен. В основе фамилии лежит личное имя Неплюй, которое давали ребенку в семье до крещения или наряду с крестильным именем. Это имя, в свою очередь, восходит к нарицательному слову «неплюй» — так в старину называли оленьего теленка до полугода.

Мирские имена, образованные от названий животных и растений, были широко распространены в дохристианской традиции восточных славян. Называя ребенка Волком, Белкой, Калиной или Неплюем, родители вкладывали в это глубокий смысл: считалось, что таким образом природа признает младенца «своим» и передаст ему качества, присущие этому существу — силу, ловкость, выносливость или связь с лесом. Имя Неплюй, хоть и звучит для современного уха непривычно, в этом ряду не было исключением: оно должно было обеспечить ребенку покровительство природы и здоровье.

Исторические документы сохранили имена реальных носителей этого прозвища. В труде С. Б. Веселовского «Ономастикон» упоминаются Федор Иванович Неплюй Кобылий, живший в начале XV века, и Иван Кузьмич Неплюй Бровцын, известный по записям 1550 года. Эти упоминания показывают, что имя не было единичным и встречалось в разных родах, а также служило основой для формирования прозвищ по отцу — так называемых полуотчеств.

Сам способ образования фамилии типичен для русского средневековья: к основе Неплюй добавили притяжательный суффикс -ев, который указывал на принадлежность. Первоначально форма Неплюев означала «сын Неплюя», «чей-то потомок». Со временем это указание на родство закрепилось как наследственное родовое имя и перешло к потомкам уже как полноценная фамилия.

Сложно точно сказать, где именно и когда фамилия возникла впервые: процесс становления русских фамилий растянулся на несколько столетий и шел неравномерно в разных землях. Однако можно уверенно говорить, что корни фамилии уходят в ту эпоху, когда личное прозвище было неотделимо от человека и несло в себе целый пласт народных верований и наблюдений за окружающим миром. Фамилия Неплюев — это не просто родовое именование, а сохранившийся до наших дней след древнего мировоззрения, в котором человек и природа существовали в тесной, почти родственной связи.