Фамилия Непйвода — редкий случай, когда написание почти кричит о своём происхождении. Перед нами пример так называемой «говорящей» фамилии-прозвища, образованной по модели глагольного императива с отрицанием: «не пей вода». В основе лежит повелительное наклонение глагола «пить» и существительное «вода». Это прямая аналогия с распространёнными фамилиями Непейвода, Непейпиво, Непейвода и другими, где предостережение от неумеренного употребления напитков было закреплено в прозвище.

Особенность варианта «Непйвода» — замена буквы «е» на «й». В русской ономастике это не опечатка, а возможный след диалектного произношения или старой орфографии. В некоторых говорах, особенно северных и сибирских, глагольная форма могла звучать как «непй» (с редуцированным гласным), что и отразилось на письме. Либо это результат упрощения при записи фамилии в документах XIX века, когда писарь фиксировал звучание на слух: «Непй» вместо «Не пей».

Суффикса в фамилии нет — она застыла в виде цельной фразы, без типичных родовых окончаний -ов, -ин или -ский. Такие бессуффиксные фамилии характерны для украинской и южнорусской традиции, но встречаются и в других регионах как прозвища, перешедшие в наследственные имена. Носитель фамилии Непйвода, скорее всего, потомок человека, получившего это прозвище за то, что он либо сам был непьющим, либо, наоборот, слишком любил выпить, и окружающие иронично предупреждали его: «Не пей воду» (то есть не увлекайся хмельным, пей воду).

Фамилия крайне редкая. В современных базах данных и телефонных справочниках она почти не встречается, что говорит о её локальном бытовании, возможно, в одной-двух деревнях или в среде старообрядцев, где такие «запретительные» прозвища были особенно популярны. Однокоренная, но более частая форма — Непейвода — фиксируется в словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) как типичный пример прозвища-наставления. Вариант с «й» — его диалектный или орфографический двойник.