Фамилия Нескин (и её форма множественного числа — Нескины) образована от имени собственного и относится к распространённому типу русских фамилий. Основой послужило имя Неска — уменьшительный вариант таких имён, как Неаниск, Неас и Нестор. То есть потомок человека по имени Неска со временем получил фамилию Нескин.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: суффикс -ин указывает на принадлежность. В русской традиции фамилии на -ин обычно возникали от основ, оканчивающихся на -а или -я, поэтому форма «Нескин» закономерно закрепилась за именем Неска. Такая модель была особенно распространена в северорусских и центральных землях, где отчество на -ин вытесняло более архаичные формы.

Само имя Нестор, к которому восходит цепочка, пришло на Русь вместе с христианством. В греческом оригинале оно означало «возвратившийся» или «вернувшийся домой» — так звали одного из участников Троянской войны, славившегося красноречием. В церковном календаре это имя связано с памятью преподобного Нестора Летописца, автора «Повести временных лет». Однако в народной среде полное имя часто сокращали, и Неска звучало естественнее, чем длинный церковный вариант.

О точном месте и времени возникновения фамилии Нескин говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, с XV по XVII век, и шёл неравномерно в разных сословиях. Сначала фамилии закрепились за знатью и купечеством, позднее — за крестьянством, после отмены крепостного права. Поэтому Нескины могли появиться и в писцовых книгах XVI века, и в ревизских сказках XIX века — без архивных изысканий по конкретной ветви ответить нельзя.

Стоит отметить, что фамилия редкая. В современной России она встречается точечно, без выраженного «гнезда» в одном регионе. Это косвенно говорит о том, что род мог быть немногочисленным или рассеянным по стране в результате миграций. Иногда схожие по звучанию фамилии Нёскин или Неськин путают с Нескиным, но это отдельные роды с иной этимологией — например, от прозвища, связанного с рекой Несью.

Несмотря на кажущуюся простоту, фамилия Нескин — памятник славянской письменности и культуры: она сохранила в себе живую народную форму имени, которое книжная традиция знает в полном виде. Такие «уменьшительные» фамилии ценны тем, что фиксируют разговорную речь прошлого, ту её часть, которая редко попадала в документы.