Фамилия Нескина образована от просторечной формы мужского крестильного имени Нестор — Неска. Само имя пришло из греческого языка и переводится как «вернувшийся домой», что отсылает к древнему обычаю называть так долгожданного или возвратившегося странника. В основе фамилии лежит не полная, а уменьшительно-обиходная форма, что сразу говорит о среде, где она возникла: так звали человека в повседневном общении, в семье или среди соседей, а не в официальных документах.

Святых покровителей у имени Нестор несколько, и все они почитаются в православной традиции. Преподобный Нестор Летописец, монах Киево-Печерского монастыря, автор «Повести временных лет», — самый известный носитель этого имени на Руси. Но были и другие: священномученик Нестор, епископ Магидийский, казнённый при императоре Деции — его распяли на кресте в Пергаме; и святой мученик Нестор, который в 306 году с благословения Димитрия Солунского победил в поединке языческого бойца, убивавшего христиан, и за это сам принял мученическую смерть. Эти примеры показывают, что имя было распространено в разных слоях общества, от книжников до простых верующих.

Суффикс -ин в фамилии Нескина указывает на принадлежность: «сын Нески» или «из семьи Нески». Такая модель типична для русского севера, Поволжья и части центральных губерний, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге и западе. Скорее всего, основатель рода был человеком из простого сословия — крестьянином или ремесленником, потому что в дворянской среде предпочитали полные формы имени, дававшие фамилии вроде Нестеров. А вот Нескины — это фамилия, которая сохранила живое, разговорное звучание и связь с обиходной речью.

Интересно, что в некоторых говорах форма Неска могла закрепиться и как самостоятельное прозвище, независимо от церковного имени. Но основная версия всё же связывает фамилию именно с Нестором: в документах XVII–XVIII веков встречаются записи крестьян и посадских людей с именем Неска, от которых и пошли Нескины. Со временем фамилия закрепилась за потомками, и сегодня Нескина — это память о предке, которого в своём кругу звали коротко и тепло, по-домашнему.