Фамилия Нестерский — это русская фамилия, образованная по географической модели. Её основа — название населённого пункта, скорее всего, села или деревни с корнем «Нестер-» (например, Нестерово, Нестеровка, Нестеров). Суффикс «-ский» в русских фамилиях традиционно указывает на происхождение из определённой местности или на принадлежность к ней. Такую фамилию мог получить человек, который переехал из такого села и стал «Нестерским» — то есть выходцем из Нестерова.

Словообразовательная модель «основа + -ский» в XVII–XIX веках активно использовалась в среде духовенства и дворянства, но также встречалась у крестьян, которые получали фамилию по названию родной деревни при переписях. Сам корень «Нестер» восходит к каноническому мужскому имени Нестор (от греческого «вернувшийся домой»). В народной речи имя часто упрощали до Нестер, поэтому фамилия Нестерский — это «вторичная» форма, образованная от топонима, который, в свою очередь, произошёл от имени первого поселенца или владельца.

География фамилии тяготеет к центральным и южным регионам России, а также к Украине и Белоруссии. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: скорее всего, предки Нестерских жили в одном или нескольких соседних сёлах с похожим названием. В отличие от фамилий на «-ов» (Нестеров), которые просто означали «сын Нестера», вариант Нестерский подчёркивает именно территориальную привязку — «из Нестерова».

Стоит учесть, что в польской и украинской традициях фамилии на «-ский» более массовы, и Нестерский мог появиться и там, особенно на землях, где жили православные или униаты. В польском языке форма «Nesterski» тоже встречается, но её корень тот же — от имени Нестер или топонима. Таким образом, фамилия Нестерский — это не про профессию или прозвище, а про место, из которого родом её первый носитель.