Фамилия Нездоровин — редкий случай, когда её основа не уходит в глубину веков, а лежит почти на поверхности. В отличие от множества фамилий, образованных от крестильных имён или названий ремёсел, эта прямо указывает на физическое состояние человека. Корень здесь — «нездоров», то есть больной, хилый, немощный. Суффикс -ин стандартно указывает на принадлежность: «чей?» — сын Нездорова. Так что первый носитель фамилии был, скорее всего, сыном или потомком человека, которого в округе прозвали Нездоровым.

Прозвище Нездоров могло появиться по разным причинам. Самая прямая — человек часто болел, был слаб здоровьем. Но в русской традиции такие «отрицательные» имена нередко давали не в насмешку, а с обережной целью. Считалось, что если назвать ребёнка Нездоровом, то злые духи не позарятся на него — и он, наоборот, вырастет крепким. Это типичная практика для дохристианских и ранних бытовых имён: Некрас, Немил, Нелюб — все они были призваны обмануть нечистую силу.

Словообразовательная модель Нездоров + ин — одна из самых распространённых в русской антропонимии. Она характерна для северных и центральных областей России, где активно использовался притяжательный суффикс. Фамилии на -ин обычно возникали от основ, оканчивающихся на -а, -я или мягкий согласный, но в случае с «Нездоров» мы видим твёрдую основу, что для -ин редкость. Это указывает на то, что прозвище могло звучать как Нездорово (с окончанием -о, как в фамилиях Болдырево, Дурново), но со временем форма подравнялась под более частотную модель.

Встречаются варианты написания — Нездоровин и реже Нездоров. Вторая форма, без суффикса, могла закрепиться как фамилия в южных регионах, где -ов был предпочтительнее. Но именно Нездоровин — более архаичный вариант, сохранивший прямую связь с прозвищем отца. В говорах слово «нездоровый» могло означать не только больного, но и капризного, привередливого человека, так что возможен и переносный смысл.

Ономастические словари (например, работы Б. Унбегауна) относят такие фамилии к группе «характеризующих», образованных от прилагательных, описывающих внешность или состояние. В отличие от фамилий-профессий или фамилий-отчеств, они не привязаны к сословию — Нездоровиными могли быть и крестьяне, и посадские люди. Дворянских родов с такой фамилией в гербовниках не зафиксировано, что тоже говорит о её простонародном происхождении.