Фамилия Ничухрина привлекает внимание редким суффиксом -ин, который указывает на принадлежность к роду по женской линии или по имени отца (Ничухра → Ничухрин → Ничухрина). Но основа здесь — прозвище или неканоническое имя Ничухра.

Слово «ничухра» в русских говорах имеет два основных значения. Первое — от «чухрать», то есть чесать, скрести, тереть; ничухра — неопрятный, неряшливый человек, который не следит за собой. Второе, более редкое — от диалектного «чухрить» (суетиться, делать кое-как) с отрицательной частицей «ни-». Тогда Ничухра — человек, который не суетится, медлительный или основательный. Оба варианта возможны, но первое значение (неряха) встречается в говорах чаще.

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: прозвище на -а (Ничухра) → притяжательное прилагательное с суффиксом -ин (Ничухрин) → фамилия. Суффикс -а в прозвищах часто давал экспрессивную, сниженную окраску, так что предок, скорее всего, получил такое прозвище за небрежность в быту или одежде.

Фамилия редкая, географически привязана к центральным и южнорусским областям — в документах XVIII–XIX веков встречается в Тульской, Рязанской, Орловской губерниях. Выходцы из крестьянской среды, незнатного сословия. Никаких известных исторических личностей с такой фамилией не зафиксировано, что говорит о её локальном, сугубо бытовом происхождении.

В написании возможны варианты: Ничухрин (мужская форма) и Ничухрина (женская). Ударение обычно падает на второй слог — Ничу́хрина.