Фамилия Нечухрина — женская форма фамилии Нечухрин, которая образована от прозвища или мирского имени Нечухра. Основа здесь — глагол «чухать» (чесать, скрести, а в некоторых говорах — понимать, смекать). С приставкой «не-» слово приобретало противоположный смысл: «нечухра» — человек нерасторопный, медлительный, либо, наоборот, тот, кто «не чешется», то есть не суетится, работает без лишней спешки.

Модель образования типична для русских фамилий: основа на -а (Нечухра) плюс патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Нечухры). Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от слов женского или общего рода с окончанием -а/-я.

Географически фамилия Нечухрин встречается в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской, Курской и Ростовской областях. Это зона бытования южнорусского акающего говора, где «чухать» означало ещё и «понимать», отсюда «нечухра» — недотёпа, простак. В северных говорах у слова был другой оттенок (чесать, скрести), но фамилия там редка.

Интересно, что фамилия Нечухрин стоит в одном ряду с однокоренными, но более редкими Нечухаев, Нечухров, Чухрин. Все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами и диалектной привязкой. Нечухрин — один из немногих вариантов, где приставка «не-» закрепилась в прозвище, а не в отчестве.

Версия о связи со словом «чухра» (щетина, жёсткие волосы) менее вероятна: для такого значения фамилия скорее имела бы суффикс -ев (Нечухрев). Поэтому основная гипотеза — прозвище по характеру или поведению, данное нерасторопному или спокойному человеку.