Фамилия Нечунаева звучит на русский слух как отчество, но за её основой, вопреки ожиданиям, стоит не имя и не ремесло, а, вероятно, чужое вопросительное слово. Самая правдоподобная версия ведёт родословную к узбекскому «нечун» — «почему?», «по какой причине?». Вряд ли предок ходил с таким вопросом в качестве имени: скорее всего, это было прозвище Нечунай, которое закрепилось за человеком любопытным, дотошным, вечно допытывающимся до сути. Впрочем, не исключено, что прозвище носило ироничный оттенок — так могли назвать того, кто задавал неуместные или наивные вопросы.

Суффикс -ева в окончании указывает на стандартную русскую модель образования фамилий от прозвищ, оканчивающихся на -ай: Нечунай → Нечунаев → Нечунаева. Аналогично строились, например, фамилии от слов «встречай» или «понимай», где прозвище превращалось в родовое имя уже в XVI–XVII веках. Таким образом, фамилия — не узбекская по происхождению носителя, а русская по форме, но с тюркским корнем в основании.

Географически фамилия прочно связана с Алтаем. Самый известный носитель — Василий Нечунаев, алтайский поэт, автор более десяти книг для детей, сборников лирики и юмористических стихов для взрослых, а также литературных пародий и переводов с немецкого. После многочисленных командировок по краю он выпустил книгу стихов юных поэтов, что говорит о глубокой региональной укоренённости рода.

Стоит оговориться: версия о «нечун» — основная, но не единственная. В русских говорах существовало слово «нечунай» в значении «непослушный», «не слышащий» — от глагола «чуять» с отрицанием. Эта гипотеза объясняет прозвище без обращения к восточным языкам, хотя и уступает первой по распространённости в ономастической литературе.

Процесс формирования фамилий был длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Нечунаевых можно лишь на основании генеалогических исследований. Пока же ясно одно: фамилия редкая, с неочевидной этимологией, и её носители, судя по всему, люди с живым, пытливым умом — если верить прозвищу предка.