Фамилия Нечухаева — женская форма фамилии Нечухаев, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: от прозвища или мирского имени при помощи суффикса -ев. Суффикс указывает на принадлежность («чей?»), то есть Нечухаев — сын или потомок человека по прозвищу Нечухай. Основа здесь нестандартная: глагольная форма с отрицанием «не» и корнем «чух-».

Корень «чух-» в русских говорах многозначен, но почти всегда связан со слухом или вниманием. В словарях Даля и областной лексики «чухать» означает слышать, чуять, понимать, а также — в некоторых диалектах — чесать, скрести. «Нечуха» или «Нечухай» — прозвище для человека нечуткого, рассеянного, того, кто «не слышит» или «не понимает» с первого раза. В этом же ряду стоят фамилии Нечуев, Нечуйвитер, Нечуйко — все они построены на отрицании глагола восприятия.

Версия о связи с глаголом «чухать» в значении «чесать» менее вероятна, хотя полностью исключать её нельзя. В некоторых южнорусских и украинских говорах «нечуха» могли назвать неряху или неопрятного человека, но такая трактовка встречается реже и не подтверждается массовым материалом. Ономасиологи (в частности, Б. Унбегаун) относят фамилии с конструкцией «не + глагол» к числу древних мирских имён-оберегов или прозвищ по характеру.

Фамилия Нечухаева — редкая. Её география неширокая: встречается в Поволжье и некоторых областях Центральной России, что типично для прозвищных фамилий, не попавших в дворянские родословные книги. Сословно предки Нечухаевых, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — в среде, где прозвища закреплялись за целыми семьями и передавались по наследству. Никакой связи с известными историческими родами или дворянскими гербами у этой фамилии нет.

Интересная деталь: в дореволюционных метрических книгах фамилия иногда писалась через «и» — Нечихаев. Это не ошибка, а следствие «якающего» произношения в ряде говоров, где безударное «у» переходило в «и». Такое колебание написания — дополнительный признак народного, некабинетного происхождения фамилии.