Фамилия Нечунаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Нечунаев уходит в XV-XVII вв. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Нечунаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Фамилия Нечунаев, скорее всего, ведет свое начало от узбекского вопросительного слова nechun («нечун»), которое в переводе на русский язык означает «почему?, по какой причине?». Скорее всего, это слово легло в основу прозвища Нечунай, которое мог получить любопытный человек. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Нечунаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Тем не менее, фамилия Нечунаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.