Фамилия Нигмаджанова — яркий пример того, как русская модель фамилии вобрала в себя восточное имя. В основе лежит арабское мужское личное имя Нигмаджан (или Нигматджан), которое, в свою очередь, состоит из двух частей: «Нигмат» (от араб. ни‘ма — «благо», «милость», «благодать») и «джан» (от перс. джан — «душа», «жизнь»). В сумме имя можно перевести как «милость души» или «благодатная душа».

Фамилия образована по классической русской патронимической схеме с суффиксом -ов, который в женском роде дает окончание -а. То есть Нигмаджанова — это буквально «дочь (или жена) Нигмаджана». Мужской вариант — Нигмаджанов. Такая модель показывает, что фамилия формировалась уже в русскоязычной среде, вероятнее всего, в среде поволжских татар или башкир, где имена арабо-персидского происхождения были широко распространены, а документы велись на русском языке.

Интересно, что в самой основе есть двойное указание на ценность человека: и как носителя божественной благодати (Нигмат), и как живую душу (Джан). Подобные составные имена — Нигматулла, Нигматжан, Гайнутджан — типичны для мусульманской традиции Поволжья и Средней Азии, где «джан» часто добавляли к имени для придания ласкового или почтительного оттенка.

Встречаются и варианты написания через «д» — Нигмаджанов, что связано с особенностями произношения: глухой звук «т» перед звонким «дж» озвончается. Фамилия не относится к числу древних дворянских — она возникла не раньше второй половины XIX века, когда у крестьян и городских сословий начали массово появляться наследственные фамилии. Носители фамилии Нигмаджанова с высокой вероятностью происходят из татарских, башкирских или казахских семей, принявших русскую форму записи.