Фамилия Нигматжанова образована по арабо-персидской модели и несёт в себе два отчётливых компонента. Первая часть — «Нигмат» (араб. نعمة, ni‘ma) означает «благо», «милость», «дар» или «благодать». Вторая — «жан» (перс. جان, jân) переводится как «душа» или «жизнь». Вместе имя Нигматжан, от которого и пошла фамилия, можно истолковать как «душа-благодать» или «дар души» — типичный для тюрко-мусульманской традиции композит, где к смысловому корню добавляют эмоционально-усилительный компонент.

Суффикс «-ова» — типичный русский патронимический показатель, который в XIX–XX веках массово присоединяли к фамилиям народов Поволжья и Средней Азии при русификации документов. В татарской, башкирской и казахской среде фамилии на «-ов/-ев» стали нормой после ревизий и переписей, когда местное население записывали по отчеству. Нигматжанова — женская форма; мужская — Нигматжанов. В исходной, нерусифицированной записи фамилия могла бы выглядеть как Нигматжан кызы (дочь Нигматжана) или просто Нигматжан.

Географически фамилия плотнее всего привязана к Татарстану, Башкортостану и Оренбургской области. Встречается она и у казахов, но реже: у казахов фамилии на «-ова» менее характерны для южных регионов, где сохраняли родовые имена (ру, жуз) в чистом виде. Носительницы Нигматжановой, скорее всего, потомки оседлых татар-мусульман или башкир, живших в деревнях и занимавшихся земледелием, торговлей или ремеслом. Дворянских корней у фамилии нет — она сугубо крестьянско-мещанская, что типично для массовых патронимических фамилий исламского мира, зафиксированных в Российской империи.

В ономастических справочниках (например, в работах Г.Ф. Саттарова по татарским фамилиям) Нигматжан разбирается как сложное имя, популярное в XVIII–XIX веках среди татар и башкир благодаря религиозному оттенку: «Нигмат» — одно из имён Аллаха в значении «Дарующий блага». Сочетание с «жан» делало имя более личным, ласковым — что-то вроде «милость моя душевная». Фамилия, таким образом, не профессия и не прозвище, а прямое указание на имя основателя рода, и в этом смысле она прозрачна и однозначна.