Фамилия Нигоднева — женская форма фамилии Нигоднев. Её основа — прозвище или нецерковное имя Нигодный, которое в древнерусском языке имело иное значение, чем сегодня. В современных словарях «негодный» означает плохой, непригодный, но в старину, особенно в северных и сибирских говорах, слово «негодный» (или «нигодный») могло относиться к человеку, который «не годится» для обычной работы — не из-за лени или злого нрава, а из-за физической слабости, болезни или старости. Так могли назвать и калеку, и беспомощного старика, и вообще того, кто по состоянию здоровья не мог быть полноценным работником.

Фамилия образована с помощью патронимического суффикса -ев, который присоединяли к основам на мягкий согласный (в данном случае к основе «Нигодн»). Встречается она редко, географически привязана в основном к центральным и южнорусским областям. В дореволюционных переписях Нигодневы фиксировались, например, в Тамбовской и Воронежской губерниях — регионах, где было много крестьян-однодворцев, сохранявших старые прозвищные фамилии.

Словообразовательная модель здесь простая, без редких суффиксов: -ев указывает на принадлежность («чей?» — сын Нигодного). Интересно, что в некоторых говорах слово «нигодный» употреблялось и в ироничном, шутливом смысле — так могли прозвать человека, который постоянно придумывает отговорки, чтобы увильнуть от дела. То есть фамилия могла закрепиться за хитрецом, а не за немощным.

В отличие от фамилий с корнем «год» (Годов, Годовников), где основа связана с временем или угождением, Нигоднев стоит особняком — его семантика упирается именно в оценку пригодности человека к труду. Это характерно для прозвищ, которые в крестьянской среде давали по практическому признаку. Прямых упоминаний в ономастических словарях (например, у Унбегауна или Никонова) эта фамилия не имеет, что подтверждает её локальный и не слишком древний характер — скорее всего, она оформилась не раньше XVII века.