Основой фамилии Никейцев послужило церковное имя Иаонникий. Мужское крестильное имя Иоанникий, вероятно, является производной формой имени Иоанн, которое в переводе с древнееврейского языка означает «милость Божья». По другой версии, имя Иоанникий связано с греческим словом «никэ» — «победа». Крестильные имена в значительной степени изменили свой облик, приспособившись к особенностям русского произношения, словоизменения и словообразования. Так, имя Иоанникий приняло в украинском языке форму Оникий, а в русском — Аникей. В основу же фамилии Никейцев легла народная форма имени Аникей – Никеец. Покровителями имени являются: преподобный Иоанникий Девиченский; мученик Иоанникий; святитель Иоанникий, патриарх Сербский; преподобномученик Иоанникий Зографский. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Никеец, со временем получил фамилию Никейцев.