Фамилия Никеенко — типичный пример украинской фамилии, образованной по отчеству. Её основа — мужское личное имя, а суффикс -енко указывает на «сына» или потомка. Если разобрать фамилию по косточкам, то Никеенко буквально значит «сын Никея»: так в быту могли называть ребёнка, отца которого звали Никей.

Само имя Никей — это разговорная, народная форма церковного имени Аникей. А вот с Аникеем история запутаннее: это одновременно вариант двух разных греческих имён. Первое — Иоанникий, которое связано со словом «никэ», то есть «победа». Второе — Аникита, от греческого «аникэтос», что переводится как «непобедимый». Оба значения благородные и почётные, хотя в русском фольклоре имя Аникей получило нелестную окраску: вспомните выражения «аника-воин» (задира, который хвастается, но терпит поражение) и «аника-смотрок» (недальновидный человек). Впрочем, к самой фамилии эти насмешливые смыслы прямого отношения не имеют — они возникли позже, как литературный или бытовой образ.

Существует и альтернативная версия, связывающая фамилию с топонимом Никея — древним городом в Малой Азии, знаменитым тем, что там проходили Вселенские соборы. Город был крупным центром Вифинии, имел право автономии в римскую эпоху, выдерживал осады арабов в VIII веке, а его храм Успения Богородицы сохранил уникальные мозаики. Однако эта гипотеза выглядит малоправдоподобной для украинской фамилии: вряд ли предки носителей фамилии имели прямое отношение к этому городу. Гораздо логичнее, что Никеенко — чисто «домашняя» фамилия, возникшая из живого имени, а не из книжной географии.

Интересно, что в украинской ономастике модель с суффиксом -енко была одной из самых продуктивных: так образовывались фамилии от самых разных имён и прозвищ. Никеенко стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Никитенко, Никоненко или Онищенко, — все они восходят к разговорным формам крестильных имён. При этом форма Никей, а не Ника или Никита, встречается реже, что делает фамилию заметной на фоне более частых вариантов.

Точных сведений о том, когда и где именно появилась фамилия Никеенко, нет — письменные источники по украинским фамилиям такого типа фрагментарны. Но можно уверенно сказать: носитель этой фамилии — потомок человека, которого в своём кругу звали Никеем, и это имя, скорее всего, несло в себе пожелание победы или непобедимости.