Фамилия Никитченко — это развёрнутое отчество, которое буквально можно прочитать как «сын Никитича», то есть внук Никиты. Такая модель образования встречается реже, чем простые отчества на -ов или -ин, и именно она делает фамилию узнаваемой.

Имя Никита пришло из греческого языка и означает «победитель». На Руси оно было распространено повсеместно, а небесным покровителем считается преподобный Никита Исповедник. От этого имени образовалось множество фамилий: Никитин, Никитский, Никитенко, Никитюк. Фамилия Никитченко стоит в этом ряду особняком из-за того, как именно её построили.

Появление звука «ч» в середине фамилии объясняется просто. Сначала от имени Никита возникло отчество Никитич. Затем от этого отчества, по той же модели, по которой от имён делали фамилии, образовали новое: Никитченко. То есть предок носителя этой фамилии был сыном человека по имени Никита, а его собственный сын уже получил фамилию, указывающую на деда. Такой «второй порядок» отчества подчёркивал родство через поколение, и в старину это звучало как «внук Никиты».

Суффикс -енко в фамилии указывает на украинское или южнорусское происхождение. В этих землях подобные формы были особенно популярны в XVII–XVIII веках, когда окончательно закреплялись фамилии у казачества и крестьянства. Ударение в фамилии обычно падает на первый слог: Ни́китченко, что тоже характерно для украинской традиции произношения.

Стоит отметить, что иногда встречается написание через «и» после «к» — Никитченко, а иногда ошибочно пишут Никитченко с одной «т», но исторически верным остаётся двойное «т», поскольку оно сохраняет основу отчества Никитич. В целом фамилия остаётся относительно редкой и несёт в себе ясную память о конкретном предке-победителе, чьё имя стало отправной точкой для целого рода.