Фамилия Никитчин образована от мужского крестильного имени Никита, которое в переводе с греческого означает «победитель». В основу фамилии легла не полная, а производная, разговорная форма этого имени — Никитча. Так на Руси в быту могли называть человека по имени Никита, и именно от этого ласково-упрощённого варианта пошла фамилия. Потомок человека, которого звали Никитчей, со временем получал фамилию Никитчин.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: к основе Никитч- добавляется притяжательный суффикс -ин, который указывает на принадлежность. То есть Никитчин буквально означает «сын Никитчи», «ребёнок Никитчи». Такая модель с суффиксом -ин характерна для фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на согласный или на -а/-я: Никитин, Фомин, Ильин. Но в случае с Никитчиным мы видим редкий случай, когда в основу легла не каноническая форма имени, а его обиходный вариант, что встречается реже и делает фамилию отличимой от более распространённой фамилии Никитин.

Интересно, что имя Никита, давшее начало фамилии, было очень популярно на Руси. Оно пришло из греческого языка вместе с христианством, и его носили многие святые, в том числе святой Никита Готский, почитаемый как воин-мученик. Возможно, именно поэтому имя так полюбилось в народе и породило множество производных форм: Никитка, Никиша, Никитча. Форма Никитча, скорее всего, бытовала в северных и центральных русских говорах, где были распространены усечённые и смягчённые варианты имён.

Родственные фамилии — Никитин, Никитский, Никитников — образованы от тех же корней, но Никитчин выделяется именно своей уменьшительной основой. Если Никитин указывает на прямого потомка Никиты, то Никитчин — на потомка человека, которого в семье или в деревне звали уменьшительно Никитчей. Это могло говорить о тёплом, домашнем отношении к предку или о его молодом возрасте на момент закрепления прозвища. В документах фамилия встречается в основном в центральной России, хотя точной географической привязки к одному региону нет — носители разбросаны по всей стране.